Serra do Topo–Caldeira de Santo Cristo–Fajã dos Cubres desce das terras altas de São Jorge até duas fajãs marcadas por lagoas costeiras. A saída junto ao parque eólico entra por um caminho de terra entre vegetação endémica e alcança um abrigo antes da longa descida. Caldeira de Cima, a ponte da Tia Júlia e um desvio para a Cascata Pequena pontuam o percurso até às fontes e aos primeiros enquadramentos sobre a Caldeira de Santo Cristo.
Na fajã, o santuário e o centro interpretativo encontram-se perto da lagoa, conhecida pela presença de amêijoas e por aves associadas ao ambiente húmido. O caminho costeiro prossegue para a Fajã do Belo, atravessando uma paisagem dominada pela falésia e por antigos acessos. Cabos instalados em setores do trajeto antecedem a Fajã dos Cubres, onde outra lagoa e a igreja assinalam o final. A caminhada reúne floresta de altitude, água doce, cascata, vertente e costa, mostrando a mudança radical entre o planalto e as pequenas superfícies habitáveis junto ao mar.
As duas lagoas têm enquadramentos diferentes: Santo Cristo surge após a descida da serra, enquanto Cubres marca a conclusão do setor costeiro. Caminhar entre ambas permite comparar duas fajãs próximas e perceber como falésia, água e depósitos costeiros definem estes habitats.