Miradouro das Lagoas–Poço do Bacalhau desce do planalto central das Flores para a Fajã Grande. O início situa-se junto às lagoas Negra e Comprida, em crateras de explosão formadas pela interação entre magma e água. A Lagoa Negra alcança grande profundidade e integra um conjunto que inclui também as lagoas Seca e Branca. O percurso parte assim de uma paisagem húmida de altitude, dominada por água, turfeiras, musgos e vegetação endémica.
A travessia passa pelas reservas naturais de Morro Alto e Pico da Sé e pela paisagem protegida da Zona Central e Falésias da Costa Oeste. Cedro-do-mato, azevinho, uva-da-serra e coberturas de esfagno acompanham os primeiros quilómetros. A descida para oeste abre gradualmente a vista sobre a Fajã Grande e sobre a grande arriba fóssil, com cerca de 300 metros, de onde caem várias linhas de água.
O final aproxima-se do Poço do Bacalhau, uma queda de água com cerca de 100 metros junto à Fajã Grande. Em apenas sete quilómetros, o trajeto muda do planalto enevoado para a costa, mas a dificuldade é elevada devido à descida, ao piso saturado e à exposição meteorológica. É uma rota marcada pela água em todas as formas: lagoas, turfa, chuva, ribeiras e cascata.